In base al Regolamento, la Direzione di Sanità e Igiene provvede alla tutela dell'igiene pubblica e della salute nel territorio dello Stato della Città del Vaticano. La Direzione nello specifico è competente per le seguenti attività Istituzionali.
La Direzione di Sanità e Igiene esplica la propria attività, oltre che nello Stato della Città del Vaticano, anche nelle Basiliche, nelle Ville Pontificie (Castel Gandolfo) e negli altri immobili e zone indicati nel Trattato Lateranense.
Elaborazione e aggiornamento del prontuario farmaceutico e dei dispositivi e presidi sanitarie erogabili; Controllo sui farmaci stupefacenti e su quelli a dispensazione protetta; Autorizzazione all’importazione e alla distribuzione delle specialità medicinali, approvate dalle competenti autorità di controllo estere e non distribuite in Italia attraverso il SSN)